香菇：味道重， 比較適合燒、油燜， 比如在熱油裡放入蔥薑， 翻炒3分鐘左右， 或者在清蒸魚裡面配香菇。
草菇：主要是爆炒， 在爆炒過程中，
金針菇：味道鮮美， 是拌涼菜和火鍋配料的上選， 但最好煮6分鐘以上， 否則容易中毒。
口蘑：味道較清淡， 煲湯最好。
味道甜的茶樹菇、杏鮑菇、袖珍菇等最適合炒制。
猴頭菇宜用高溫、旺火燒煮。 但總的來說， 菌類最好還是以清炒或清燉方法為主， 才不失蘑菇的原汁原味。
此外， 做菜時， 盡可能把蘑菇切得小一點， 因為它的纖維素不僅不好消化， 而且還會影響消化液進入其它食物。 但是蘑菇浸出物、游離氨基酸和芳香物質卻能增進食欲， 促使胃液分泌， 從而有利於更好地吸收其它食物。
